Développement d'une nouvelle trousse de PCR en temps réel pour la détection et la quantification du Torque Teno Virus (TTV) et évaluation de sa place dans le suivi de l'état immunitaire de patients transplantés de rein
(Document en Français)
- Le texte intégral de cette thèse sera accessible aux membres de l'enseignement supérieur français à partir du21/06/2098
- Auteur
- Kulifaj Dorian
- Date de soutenance
- 21-06-2018
- Directeur(s) de thèse
- Alain Sophie - Barranger Côme
- Rapporteurs
- Fafi-Kremer Samira - Pillet Sylvie
- Membres du jury
- Essig Marie - Maggi Fabrizio
- Laboratoire
- RESINFIT - Anti-infectieux : supports moléculaires des résistances et innovations thérapeutiques - UMR Inserm 1092
- Ecole doctorale
- École doctorale biologie-santé - Bio-santé (Limoges ; 2009-2018)
- Etablissement de soutenance
- Limoges
- Discipline
- Biologie Sciences Santé
- Classification
- Sciences de la vie, biologie, biochimie,
- Médecine et santé
- Mots-clés libres
- Transplantation, Immunosuppression, Infections virale, Rejet, Torque teno virus, Quantification, Test de qPCR standardisé
- Mots-clés
- Rein -- Transplantation,
- Immunosuppression,
- Rejet de greffe,
- Virus TTV
Contexte : Le virus Torque Teno (TTV) est un petit virus à ADN fortement prévalent dont la réplication est étroitement liée à l'état immunitaire. Un nombre croissant de publications soulignent le potentiel de la charge virale du TTV en tant qu'indicateur d'immunosuppression chez les patients transplantés. Des tests cliniques sont nécessaires pour caractériser davantage son potentiel en tant que marqueur d'immunosuppression.Objectifs : Présentation de la faisabilité/optimisation et démonstration des performances analytiques et cliniques du premier test standardisé utilisé pour détecter et quantifier l'ADN du TTV humain dans le sang total et le plasma de diverses populations. La charge virale du TTV a été analysée sur des échantillons de sang total prélevés chez 31 volontaires sains, chez 53 donneurs de reins décédés et cours du suivi de 42 receveurs d’une greffe de rein.Résultats : La limite de détection de la trousse développée était de 2,2 log10 copies/ml dans le sang total et le plasma, la linéarité et la précision ont été démontrées entre 1,61 et 10,61 log10 copies/ml dans le sang total. La prévalence de l'ADN du TTV dans le sang variait significativement entre les groupes : 45% chez les volontaires sains, 74% chez les donneurs et 83% chez les receveurs de rein. Chez les receveurs de rein, les cinétiques TTV précoces étaient comparables à celles précédemment présentées dans la littérature (dans d'autres contextes de transplantation) : la charge virale est passée d'une moyenne de 4,3 log10 à 7,9 log10 copies/mL dans les 75 premiers jours post transplantation. L’analyse des séquences de TTV par séquençage haut débit nous a permis de décrire la prévalence des génotypes de TTV chez 20 donneur et receveurs appariés.Conclusion : Ce test TTV a montré une sensibilité analytique, une spécificité, une linéarité et une précision élevée. Avec ce test, la cinétique précoce chez les receveurs de rein est proche de celle précédemment décrite chez les receveurs de greffe de poumon. C'est un outil standardisé utile pour évaluer davantage la charge de TTV en tant que biomarqueur de l'état immunitaire qui pourrait améliorer la stratégie de traitement individuel.
- Type de contenu
- Text
- Format
Pour citer cette thèse
Kulifaj Dorian, Développement d'une nouvelle trousse de PCR en temps réel pour la détection et la quantification du Torque Teno Virus (TTV) et évaluation de sa place dans le suivi de l'état immunitaire de patients transplantés de rein, thèse de doctorat, Limoges, Université de Limoges, 2018. Disponible sur https://aurore.unilim.fr/ori-oai-search/notice/view/2018LIMO0014