Apport de la PCR dans le diagnostic des infections fongiques invasives

Discipline

Médecine générale

Classification

Médecine et santé

Mots-clés

Mycoses - Diagnostic - Thèses et écrits académiques,

Réaction de polymérisation en chaîne - Thèses et écrits académiques,

Biologie moléculaire fongique - Thèses et écrits académiques

L’incidence des infections fongiques invasives est en constante augmentation avec l’émergence d’espèces de plus en plus variées. Une identification rapide et précise de l’agent pathogène est essentielle pour la mise en place d’une thérapeutique adaptée. Nous avons développé deux techniques de PCR panfongique avec séquençage des régions ITS1 ou ITS1-5,8S-ITS2 et une technique de PCR spécifique Aspergillus fumigatus. Ces techniques ont été réalisées sur 34 souches fongiques issues de notre laboratoire et sur 35 prélèvements biologiques congelés issus de 12 patients avec une infection fongique invasive prouvée ou probable. Les séquences ont été comparées à la base de données Genbank. Les techniques de biologie moléculaire ont pu identifier un pathogène fongique dans 77% des prélèvements biologiques en corrélation avec l’examen direct microscopique et/ou la culture. De plus, l’identification précise de genre et d’espèce a été possible dans 14 cas avec identification incomplète ou impossible par les méthodes conventionnelles de diagnostic. Ces résultats corroborent l’intérêt de la biologie moléculaire en combinaison avec l’examen direct microscopique et la culture dans le diagnostic des infections fongiques invasives.