Intérêt de la MLPA dans la stratégie de diagnostic génétique des troubles du spectre autistique

Discipline

Biologie Médicale

Classification

Médecine et santé

Mots-clés

Troubles du spectre de l'autisme - Thèses et écrits académiques,

Dépistage génétique - Thèses et écrits académiques,

MLPA (génétique) - Thèses et écrits académiques

Introduction : Les variations du nombre de copies (CNVs) sont une étiologie importante des troubles du spectre autistique (TSA). Ces CNVs sont identifiés grâce à l’analyse chromosomique sur puce à ADN (ACPA), actuellement l’examen de 1ère intention dans les TSA, chez environ 10 % des patients. Une technique alternative, mais ciblée sur des loci particuliers, est l’amplification multiplexe de sondes dépendant d'une ligation (MLPA), de réalisation technique plus simple et moins coûteuse que l’ACPA. L’objectif était d’étudier l’intérêt et le rendement diagnostique de la MLPA ciblant les régions 15q11-q13, 16p11.2 et 22q13.3 dans la stratégie de diagnostic génétique des TSA. Méthodes : une analyse par MLPA, kit p343-Autism1 (MRC Holland), a été réalisée chez 81 patients présentant un TSA ou des caractéristiques autistiques, adressés à l’hôpital mère enfant de Limoges entre le mois de janvier 2014 et le mois de février 2016. Résultats : un CNV a été mis en évidence chez 7 patients (8,6 %) : 4 au niveau de la région 15q11-q13 : une délétion BP3-BP4 maternelle, une duplication BP2-BP4 et deux duplications du gène CHRNA7 seul ; deux duplications au niveau de la région 16p11.2, une paternelle et une de novo ; une délétion au niveau de la région 22q13.3, sur un chromosome 22 en anneau. Discussion : La MLPA est une technique performante, qui a un bon rendement diagnostique en comparaison à l’ACPA. A cause du caractère uniquement ciblé de la MLPA, l’ACPA reste l’examen diagnostique à privilégier en 1ère intention, mais nécessite de vérifier que les puces utilisées aient une densité suffisante de sondes oligonucléotidiques au niveau de toutes les régions connues impliquées dans les TSA.