Dissémination sous pression anthropique et de la saisonnalité de bactéries résistantes dans les fleuves du Liban

Discipline

Santé publique, épidémiologie, environnement et sociétés

Classification

Sciences de la vie, biologie, biochimie,

Médecine et santé

Mots-clés libres

BRAs, GRA, Indicateurs, Fleuves, Estuaires, Liban, Pression anthropique

Mots-clés

Bactéries pathogènes - Contamination,

Cours d'eau -- Liban

L’évaluation de la contamination des fleuves majeurs au Liban par des bactéries résistantes aux agents antimicrobiens (BRAs) et des bactéries pathogènes à haut risque a été effectuée à travers des méthodes de culture standard en hiver 2018. Ainsi, la détection d’Enterobacterales et de Pseudomonas spp. résistants et de Staphylococcus aureus résistants à la méthicilline (SARM) a permis de déterminer des points sous haute pression anthropique de la (des) source(s) jusqu’aux estuaires des fleuves majeurs. Les estuaires de ces fleuves et des souches d’Enterobacterales sécrétrices de β-lactamase à spectre étendu isolées dans ces estuaires ont en plus fait l’objet d’une recherche du résistome à deux saisons différentes (au printemps et en hiver) par qPCR à haut débit. Deux indicateurs viraux de contamination fécale humaine, le crAssphage et le Torque Teno virus (TTV), ont été recherchés aux deux saisons au niveau des estuaires pour étudier l’association entre l’abondance en gènes de résistance aux agents antimicrobiens (GRAs) et la contamination fécale. L’approche combinée utilisant des techniques de culture et une qPCR à haut débit pour la détection de GRAs et de BRAs a permis d'identifier des points sous haute pression anthropique au niveau des fleuves majeurs libanais.