Analyse du transcriptome du virus d'Esptein-Barr (EBV) par séquençage de nouvelle génération (NGS) dans les cellules et les exosomes de lymphomes humains et particulièrement de lymphome T angio-immunoblastique (LAI)

Discipline

Immunologie, oncologie, inflammation et infectiologie

Classification

Sciences de la vie, biologie, biochimie,

Médecine et santé

Mots-clés libres

Exosome, Immunoévasion, EBV, Lymphome T angio-immunoblastique, LAI, NGS

Mots-clés

Virus d'Epstein-Barr,

Lymphadénopathie angio-immunoblastique,

Cancérogenèse,

Séquençage à haut débit

Le virus d’Epstein-Barr (EBV), herpèsvirus oncogène, est associé à des carcinomes et lymphomes B ou T. Le lymphome T angio-immunoblastique (LAI) porte l’EBV dans 90% des cas sans qu’on sache quel rôle il y joue. Les exosomes, petites vésicules liées à la membrane, transportent un grand nombre de molécules pour favoriser la communication intercellulaire. L’EBV pourrait utiliser les exosomes pour contribuer au développement et à la dissémination de néoplasies. Afin d’éclaircir ces points, nous avons étudié le transcriptome de l’EBV dans les adénopathies de 14 LAI et 21 autres lymphomes B et T, ainsi que de 11 lignées cellulaires, puis dans les exosomes de ces mêmes lignées. Un séquençage de nouvelle génération (NGS) avec technique de capture des ARN viraux a été réalisé. Les « reads » obtenus ont été alignés contre le génome de l’EBV et normalisés en transcrits par million (TPM). Les transcrits BART étaient les transcrits de latence les plus exprimés dans les LAI suggérant qu’ils jouent un rôle dans cette pathologie. Les LAI présentaient une latence de type IIc avec expression de BNLF2a et des protéines de latence II. L’expression simultanée de BCRF1, interleukine-10 virale, et de BNLF2a, bloquant la présentation antigénique aux lymphocytes T cytotoxiques, pourrait participer à la survie des cellules tumorales infectées. Les transcrits de BNLF2a et BKRF4, protéines impliquées dans l’immunoévasion, ont été trouvés en abondance dans les exosomes de toutes les lignées. Les transcrits d’autres gènes, codant des protéines impliquées dans l’immunoévasion ou dans la prolifération cellulaire, ont aussi été trouvés à un taux élevé dans les exosomes de la plupart des lignées.Les résultats obtenus laissent envisager une participation de l’EBV à la pathologie du LAI. Le virus pourrait utiliser les exosomes pour transporter des molécules permettant de renforcer sa participation dans l’oncogenèse et sa fonction dans l’échappement au système immunitaire.