Étude de la méthode de Fractionnement par couplage Flux-Force de Sédimentation comme nouvelle technique d’antibiogramme rapide

Discipline

Biologie Chimie Santé mention Recherche clinique, innovation technologique et thérapeutique

Classification

Médecine et santé

Mots-clés libres

Antibiogramme, Diagnostic rapide, SdFFF, Bactéries à Gram négatif, Antibiorésistance

Mots-clés

Antibiogramme,

Fractionnement par couplage flux-force,

Bactéries Gram négatives,

Résistance aux antibiotiques

L’augmentation de l’antibiorésistance est devenue un problème de santé publique majeur. Le développement de méthodes d'antibiogrammes rapides, permettant une antibiothérapie adaptée plus précoce, est une priorité. Cette étude avait pour objectif d'évaluer les performances de la technologie de Fractionnement par Couplage Flux-Force de Sédimentation (SdFFF) pour l’obtention d’un antibiogramme en moins de 3 heures (contre 16 à 24h pour les méthodes actuelles de référence).La SdFFF détecte des changements physico-chimiques précoces des bactéries en utilisant une technologie de type chromatographique. Une preuve de concept a été réalisée sur 3 espèces bactériennes, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae et Pseudomonas aeruginosa. Par la suite, une étude incluant 100 souches cliniques de E. coli et 50 de K. pneumoniae a été réalisée avec 7 antibiotiques. L'évaluation a été effectuée par comparaison avec la méthode de référence de microdilution en milieu liquide, selon la norme ISO 20776-2.Les résultats montrent que la SdFFF permet d’obtenir en 3h un antibiogramme dont l’accord catégorique (CA) avec la méthode de référence, la sensibilité (Se) et la spécificité (Sp) sont de 98,9 %, 98,9 % et 98,9 % pour E. coli et 99,4 %, 99,3 % et 99,5 % pour K. pneumoniae, respectivement. L’analyse combinée des deux espèces a montré un CA de 98,6 %, une Se de 98,0 % et une Sp de 99,0 %. Ces résultats sont conformes à la norme ISO 20776-2 (CA ≥ 90%, Se et Sp ≥ 95%).Cette étude montre que la SdFFF a le potentiel pour être utilisée comme une méthode d'antibiogramme phénotypique rapide et fiable.