Analyse par séquençage ARN à haut débit du répertoire des immunoglobulines : un outil diagnostique dans les gammapathies monoclonales de signification clinique, en particulier dans le syndrome POEMS et l’Amylose AL.

Discipline

Biologie Chimie Santé mention Immunologie, oncologie, inflammation, infectiologie

Classification

Médecine et santé

Mots-clés libres

Amylose AL, Séquençage ARN, Chaines légères, Mgcs, Immunoglobulines, Syndrome POEMS

Mots-clés

Amylose AL,

Séquençage de l'ARN,

Immunoglobulines,

Syndrome POEMS

Depuis 2018, nous avons mis en place le séquençage à haut débit sur base ARN (5’RACE-RepSeq) du répertoire des immunoglobulines et nous avons analysé l’ARNm codant pour les immunoglobulines dans plus de 500 patients suspects de maladies liées aux gammapathies, en nous concentrant ici sur l’amylose AL et le syndrome POEMS. Cette technique fournit des informations complètes sur la région V(D)J du répertoire dominant d’immunoglobulines, permettant l’analyse des modèles mutationnels, des fréquences variables des gènes des immunoglobulines et de la diversité résultant de l’hypermutation somatique. Notre analyse, qui intègre des données cliniques, histologiques et biologiques provenant de plus de 90 % des patients, a établi une base de données robuste englobant Amylose AL, POEMS et d'autres gammapathies monoclonales de signification clinique. En tirant parti de cet ensemble de données unique, nous avons démontré que la présence d’un clone IGLV1-36, 1-40 ou 1-44 avec l’un des motifs mutationnels récurrents (P/A/G/D/YS) VNWYQ associé au IGLJ3*02 en cas de suspicion de syndrome POEMS peut être considéré comme un biomarqueur spécifique à 100% avec une précision de 80%. Nous avons également généré de nombreuses données originales dans le contexte de l’Amylose AL : la majorité des patients ont une atteinte cardiaque et rénale avec en médiane 3 organes touchés ; les gènes variables IGLV6-57, IGLV3-1, IGLV1-44, IGLV1-51, et IGKV1-33 (34%), IGKV1-16 (15%), et à moindre mesure IGKV6-21 (5%), sont surreprésentés par rapport aux autres gammapathies monoclonales et au répertoire médullaire polyclonal ; il n’y a pas de corrélation entre l’importance du clone au sein du répertoire médullaire, le gène VL utilisé ni le taux de chaines légères circulantes. Nous avons pu établir des score physicochimiques de chaque séquence qui vont nous permettre d’établir un outil de prédiction de pathogénicité des chaines légères grâce à l’intelligence artificielle.