Mise en place du séquençage en routine dans le service de mycologie du CHU de Limoges pour le diagnostic de champignons d’identification difficile

Discipline

Biologie médicale

Classification

Médecine et santé

Mots-clés

Champignons,

Mycologie médicale,

Analyse de séquence d'ADN - Dissertation universitaire

Les champignons représentent un taxon très important et beaucoup peuvent être responsables de pathologie humaine. Dans la cadre des infections fongiques, une prise en charge spécifique à l’espèce est nécessaire pour traiter au mieux le patient. La juste identification du champignon est alors primordiale. Au sein du service de Parasitologie- Mycologie du Centre Hospitalo Universitaire de Limoges, il existe déjà des techniques morphologiques et spectrométriques qui permettent l’identification des champignons, mais elles peuvent être complétées par une approche d’identification moléculaire plus précise, plus sensible et pouvant renforcer le diagnostic d’identification difficile. Ce travail de thèse a permis d’évaluer l’apport du séquençage Sanger de la région ITS (Internal Transcribed Spicer) en routine pour ces champignons d’identification difficile. Il a permis de trouver les avantages de la technique et d’en estimer la faisabilité.