Identification des bacilles à Gram négatif non fermentants dans la mucoviscidose : évaluation des performances de la carte VITEK 2 GN (Biomérieux) et mise en évidence du risque de confusion diagnostique des espèces Herbaspirillum huttiense et du complexe Burkholderia cepacia par les tests phénotypiques

Discipline

Pharmacie

Classification

Médecine et santé

Mots-clés

Mucoviscidose - Thèses et écrits académiques,

Bactéries Gram négatives - Identification - Thèses et écrits académiques

Au cours de la mucoviscidose, maladie génétique autosomique récessive la plus fréquemment rencontrée dans la population caucasienne, le spectre bactérien responsable des colonisations/infections pulmonaires, autrefois étroit et représenté par la triade S. aureus, H. influenzae et P. aeruginosa, s'étoffe d'années en années avec l'émergence notable de diverses espèces de bacilles à Gram négatif non fermentants (BGNNF) telles que S. maltophilia, A. xylosoxidans et B. cepacia et plus rarement Burkholderia gladioli, Pandoraea sp., Ralstonia sp., Inquilinus sp., et Chryseobacterium sp.. Dans le passé, les méthodes phénotypiques ont montré des performances moyennes dans l'identification des BGNNF issus de patients mucoviscidosiques. Ce travail a eu pour but de déterminer les performances de la carte colorimétrique VITEK 2 GN, mise sur le marché en 2004 et utilisée en routine dans notre laboratoire, pour l'identification de ces bactéries. Avec un taux d'identifications correctes de 85,1%, la carte VITEK 2 GN présente une performance d'identification des BGNNF relativement satisfaisante, étant donné les atypies que présentent les isolats de mucoviscidose. Nous avons également mis en évidence le risque de confusion de l'espèce Herbaspirillum huttiense avec les espèces du complexe cepacia par la mise en oeuvre de méthodes d'identification phénotypiques (API20 NE et VITEK 2 GN). H. huttiense, retrouvé de façon transitoire chez les patients étudiés, ne semble pas être à l'origine d'une détérioration pulmonaire. Ce germe pourrait constituer un germe émergent dans la mucoviscidose